33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6081 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008392  Bamb_6081  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  317  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0479764  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5845  MEKHLA domain-containing protein  95.39 
 
 
152 aa  300  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633795  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1015  hypothetical protein  75.66 
 
 
155 aa  244  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2234  hypothetical protein  75.66 
 
 
155 aa  244  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0773344  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2092  hypothetical protein  75.66 
 
 
155 aa  244  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2037  hypothetical protein  75 
 
 
157 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0596866  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5830  MEKHLA domain-containing protein  62.91 
 
 
153 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4480  MEKHLA domain-containing protein  59.72 
 
 
147 aa  163  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0667003  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1410  MEKHLA domain protein  51.33 
 
 
154 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.842617  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2107  hypothetical protein  51.41 
 
 
153 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3526  MEKHLA domain protein  51.77 
 
 
147 aa  147  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.897252  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3398  MEKHLA domain protein  51.37 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3202  MEKHLA domain-containing protein  51.06 
 
 
147 aa  144  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888001 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5404  MEKHLA domain protein  48.55 
 
 
159 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02707  hypothetical protein  51.77 
 
 
146 aa  140  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.363866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0608  hypothetical protein  46.27 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0268  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2229  MEKHLA domain-containing protein  40.69 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3256  hypothetical protein  40.3 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3312  MEKHLA domain protein  40.85 
 
 
156 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1380  MEKHLA domain protein  41.06 
 
 
167 aa  108  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0755  hypothetical protein  39.16 
 
 
146 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2659  MEKHLA domain protein  36.49 
 
 
158 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3445  MEKHLA domain protein  35.81 
 
 
158 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2107  hypothetical protein  40.15 
 
 
158 aa  101  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.331379  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1970  hypothetical protein  31.03 
 
 
158 aa  97.4  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2177  hypothetical protein  36.84 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10568  predicted protein  34.62 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0449986  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2523  hypothetical protein  41.75 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256776  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28401  hypothetical protein  37.37 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5439  hypothetical protein  60.98 
 
 
49 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9007  predicted protein  32.67 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0518  MEKHLA domain protein  35.29 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>