32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1970 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1970  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  328  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2107  hypothetical protein  49.34 
 
 
158 aa  168  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.331379  normal  0.200017 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3312  MEKHLA domain protein  50.66 
 
 
156 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3256  hypothetical protein  45.81 
 
 
159 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0268  hypothetical protein  48.37 
 
 
160 aa  145  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2659  MEKHLA domain protein  47.06 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3445  MEKHLA domain protein  47.06 
 
 
158 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1380  MEKHLA domain protein  42.38 
 
 
167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0608  hypothetical protein  36.55 
 
 
157 aa  117  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.322967  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_10568  predicted protein  38.03 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0449986  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2523  hypothetical protein  42.74 
 
 
159 aa  103  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.256776  normal  0.936352 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2177  hypothetical protein  37.01 
 
 
159 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5845  MEKHLA domain-containing protein  34.67 
 
 
152 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633795  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1410  MEKHLA domain protein  35.29 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.842617  normal  0.359556 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6081  hypothetical protein  31.03 
 
 
152 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0479764  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2037  hypothetical protein  30.26 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0596866  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1015  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  94  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2092  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2234  hypothetical protein  32.19 
 
 
155 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0773344  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5404  MEKHLA domain protein  37.74 
 
 
159 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5830  MEKHLA domain-containing protein  36.27 
 
 
153 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4480  MEKHLA domain-containing protein  36.11 
 
 
147 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0667003  normal  0.38463 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2107  hypothetical protein  31.78 
 
 
153 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3398  MEKHLA domain protein  32.71 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3202  MEKHLA domain-containing protein  29.77 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3526  MEKHLA domain protein  29.77 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.897252  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0518  MEKHLA domain protein  32.45 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02707  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  73.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.363866  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28401  hypothetical protein  30.52 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0755  hypothetical protein  31.34 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2229  MEKHLA domain-containing protein  30.66 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283455 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9007  predicted protein  24.51 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>