More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0560 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0560  pyruvate phosphate dikinase  100 
 
 		 856 aa  1721    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.433086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2357  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  43.79 
 
 		 827 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000953351  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1059  pyruvate, phosphate dikinase  44.2 
 
 		 882 aa  481  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0506  pyruvate phosphate dikinase  40.05 
 
 		 844 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.886876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3442  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  38.66 
 
 		 830 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3777  pyruvate phosphate dikinase  44.6 
 
 		 876 aa  466  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0430097  normal  0.108165 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1318  pyruvate phosphate dikinase  40.79 
 
 		 889 aa  462  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0356  pyruvate, phosphate dikinase  45.24 
 
 		 912 aa  462  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1351  pyruvate phosphate dikinase  45.77 
 
 		 877 aa  459  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.154627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0676  pyruvate phosphate dikinase  45.79 
 
 		 881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1983  pyruvate phosphate dikinase  35.15 
 
 		 876 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0652  pyruvate phosphate dikinase  45.61 
 
 		 881 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.475714  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2268  pyruvate phosphate dikinase  35.04 
 
 		 876 aa  452  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4251  pyruvate phosphate dikinase  44.7 
 
 		 882 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0607  pyruvate phosphate dikinase  42.39 
 
 		 881 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0607197  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1211  pyruvate phosphate dikinase  42.53 
 
 		 882 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.48137  normal  0.179954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3044  pyruvate phosphate dikinase  44.27 
 
 		 887 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.157532  normal  0.220677 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1608  pyruvate phosphate dikinase  46.1 
 
 		 892 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.470093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1064  pyruvate phosphate dikinase  44.21 
 
 		 890 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.844864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2562  pyruvate phosphate dikinase  40.57 
 
 		 939 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0317  pyruvate phosphate dikinase  45.39 
 
 		 886 aa  437  1e-121  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.45614  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1670  pyruvate phosphate dikinase  35.01 
 
 		 881 aa  436  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.4931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1409  pyruvate phosphate dikinase  43.92 
 
 		 883 aa  438  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000166258  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2482  pyruvate phosphate dikinase  44.21 
 
 		 889 aa  436  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.634119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0642  pyruvate phosphate dikinase  43.77 
 
 		 912 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0698603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1926  pyruvate phosphate dikinase  41.07 
 
 		 890 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2469  pyruvate phosphate dikinase  42.63 
 
 		 885 aa  436  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21988  predicted protein  43.58 
 
 		 1011 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1308  pyruvate phosphate dikinase  43.46 
 
 		 883 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0607  pyruvate phosphate dikinase  43.72 
 
 		 884 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1243  pyruvate phosphate dikinase  43.11 
 
 		 876 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0155  pyruvate phosphate dikinase  42.1 
 
 		 916 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0162  pyruvate phosphate dikinase  40.12 
 
 		 912 aa  427  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.703122 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0158  pyruvate phosphate dikinase  43.76 
 
 		 881 aa  426  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.103685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0651  pyruvate phosphate dikinase  42.45 
 
 		 873 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000914255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2170  pyruvate phosphate dikinase  33.17 
 
 		 875 aa  424  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0942  pyruvate, phosphate dikinase  41.31 
 
 		 893 aa  426  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214985  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3206  pyruvate, phosphate dikinase  44.7 
 
 		 877 aa  426  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0226352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0523  pyruvate phosphate dikinase  39.73 
 
 		 916 aa  425  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0385  pyruvate phosphate dikinase  40.7 
 
 		 984 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12273  hitchhiker  0.000630712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1396  pyruvate phosphate dikinase  42.48 
 
 		 882 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4859  pyruvate phosphate dikinase  44.52 
 
 		 889 aa  422  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1610  pyruvate phosphate dikinase  44.59 
 
 		 885 aa  422  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.617051  normal  0.1621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1512  pyruvate phosphate dikinase  39.09 
 
 		 880 aa  420  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2194  pyruvate phosphate dikinase  35.27 
 
 		 886 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.193321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4160  pyruvate phosphate dikinase  43.96 
 
 		 961 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4187  pyruvate phosphate dikinase  43.96 
 
 		 961 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0757879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1661  pyruvate phosphate dikinase  44.82 
 
 		 916 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0088  pyruvate phosphate dikinase  41.14 
 
 		 931 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3505  pyruvate phosphate dikinase  36.9 
 
 		 937 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0518  pyruvate phosphate dikinase  40.46 
 
 		 940 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2386  pyruvate, phosphate dikinase  39.44 
 
 		 880 aa  415  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.728002  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0418  pyruvate phosphate dikinase  41.97 
 
 		 895 aa  413  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.219679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2940  pyruvate phosphate dikinase  40.22 
 
 		 888 aa  416  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.915512  hitchhiker  0.000023243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2347  pyruvate phosphate dikinase  41.78 
 
 		 880 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4089  pyruvate phosphate dikinase  40.25 
 
 		 932 aa  416  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0987  pyruvate phosphate dikinase  43.77 
 
 		 897 aa  413  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0801  pyruvate phosphate dikinase  44.17 
 
 		 896 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.214034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3511  pyruvate phosphate dikinase  43.89 
 
 		 885 aa  416  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00038474  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1008  pyruvate phosphate dikinase  34.42 
 
 		 916 aa  410  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2110  pyruvate phosphate dikinase  41.2 
 
 		 887 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.865175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0457  pyruvate phosphate dikinase  40.54 
 
 		 916 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0644  pyruvate phosphate dikinase  41.45 
 
 		 914 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00825191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7028  pyruvate phosphate dikinase  43.12 
 
 		 905 aa  412  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224146 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0479  pyruvate phosphate dikinase  42.18 
 
 		 915 aa  412  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0629  pyruvate phosphate dikinase  41.65 
 
 		 916 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3020  pyruvate phosphate dikinase  40.41 
 
 		 906 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0863  pyruvate phosphate dikinase  40.61 
 
 		 891 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1184  pyruvate, phosphate dikinase  43.53 
 
 		 878 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2709  pyruvate phosphate dikinase  42.24 
 
 		 1028 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0745  pyruvate, phosphate dikinase  46.68 
 
 		 898 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4044  pyruvate phosphate dikinase  36.28 
 
 		 962 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1141  pyruvate phosphate dikinase  37.64 
 
 		 916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.722575 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2657  pyruvate phosphate dikinase  43.8 
 
 		 916 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0686  pyruvate phosphate dikinase  42.59 
 
 		 887 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.463227  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0716  pyruvate phosphate dikinase  41.51 
 
 		 899 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0966  pyruvate phosphate dikinase  40.95 
 
 		 884 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.384178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0503  pyruvate phosphate dikinase  41.72 
 
 		 887 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0772  pyruvate phosphate dikinase  43.1 
 
 		 887 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.134645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2177  pyruvate phosphate dikinase  39.88 
 
 		 890 aa  409  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.799744 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17560  pyruvate phosphate dikinase  39.43 
 
 		 886 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0444691  normal  0.838681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2420  pyruvate, phosphate dikinase  39.15 
 
 		 907 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.396323  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0856  pyruvate, phosphate dikinase  41.65 
 
 		 991 aa  405  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000257444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2179  pyruvate phosphate dikinase  41.9 
 
 		 895 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.514386 
 
 
-
 
NC_004310  BR0500  pyruvate phosphate dikinase  41.55 
 
 		 887 aa  405  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0657  pyruvate phosphate dikinase  41.28 
 
 		 914 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13952e-22 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0548  pyruvate phosphate dikinase  41.9 
 
 		 898 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462539  normal  0.844122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1243  pyruvate phosphate dikinase  41.24 
 
 		 1008 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.147506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1099  pyruvate phosphate dikinase  41.24 
 
 		 1004 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.895703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2762  pyruvate phosphate dikinase  34.44 
 
 		 886 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2360  pyruvate phosphate dikinase  42.21 
 
 		 987 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.797311  normal  0.119271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3566  pyruvate phosphate dikinase  42.1 
 
 		 892 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0580  pyruvate phosphate dikinase  42.17 
 
 		 888 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1974  pyruvate phosphate dikinase  39.6 
 
 		 914 aa  402  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.188797  hitchhiker  0.000108707 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4343  pyruvate phosphate dikinase  41.07 
 
 		 991 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.19603 
 
 
-
 
NC_002978  WD0690  pyruvate phosphate dikinase  38.62 
 
 		 912 aa  398  1e-109  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3671  pyruvate phosphate dikinase  41.55 
 
 		 886 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000280199  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0696  pyruvate phosphate dikinase  41.96 
 
 		 920 aa  399  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000314869  hitchhiker  0.0000641811 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2770  pyruvate phosphate dikinase  37.81 
 
 		 896 aa  398  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.819707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0494  pyruvate phosphate dikinase  42.88 
 
 		 886 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>