21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1923 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1923  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2117  hypothetical protein  54.31 
 
 
232 aa  215  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2176  hypothetical protein  53.81 
 
 
212 aa  204  9e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1568  hypothetical protein  53.76 
 
 
193 aa  202  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238081  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1481  hypothetical protein  45.6 
 
 
205 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0740  hypothetical protein  38.83 
 
 
182 aa  134  8e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1634  hypothetical protein  38.83 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1208  hypothetical protein  36.16 
 
 
198 aa  122  3e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1913  hypothetical protein  34.02 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1268  hypothetical protein  32.97 
 
 
223 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1441  hypothetical protein  32.32 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284407  hitchhiker  0.0013886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0320  hypothetical protein  28.32 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1103  hypothetical protein  23.7 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0541  hypothetical protein  25.17 
 
 
184 aa  55.8  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.9415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1615  hypothetical protein  30.38 
 
 
165 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000108302  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1148  hypothetical protein  27.49 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0909  hypothetical protein  23.39 
 
 
162 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.784757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0758  hypothetical protein  24.7 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1691  hypothetical protein  21.59 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0221  hypothetical protein  19.64 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1526  hypothetical protein  19.41 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.774017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>