21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0909 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0909  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  327  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.784757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0221  hypothetical protein  90.12 
 
 
162 aa  297  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1691  hypothetical protein  92.59 
 
 
162 aa  279  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1526  hypothetical protein  63.58 
 
 
162 aa  223  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.774017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0758  hypothetical protein  43.64 
 
 
165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1148  hypothetical protein  43.64 
 
 
169 aa  140  7e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1103  hypothetical protein  37.95 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0541  hypothetical protein  33.73 
 
 
184 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.9415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1615  hypothetical protein  36.36 
 
 
165 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000108302  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1208  hypothetical protein  26.71 
 
 
198 aa  58.2  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0740  hypothetical protein  26 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1568  hypothetical protein  38.98 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238081  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1481  hypothetical protein  34.62 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1923  hypothetical protein  24.28 
 
 
211 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0320  hypothetical protein  29.41 
 
 
214 aa  48.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2117  hypothetical protein  40.38 
 
 
232 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2176  hypothetical protein  38.18 
 
 
212 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1268  hypothetical protein  25.71 
 
 
223 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1441  hypothetical protein  27.59 
 
 
225 aa  45.1  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284407  hitchhiker  0.0013886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1913  hypothetical protein  34.62 
 
 
224 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1634  hypothetical protein  22.37 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>