22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1148 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1148  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  339  8e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0758  hypothetical protein  70.3 
 
 
165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0221  hypothetical protein  43.03 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1691  hypothetical protein  46.67 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0909  hypothetical protein  43.64 
 
 
162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.784757  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1526  hypothetical protein  40.37 
 
 
162 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.774017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1103  hypothetical protein  37.57 
 
 
169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0541  hypothetical protein  33.54 
 
 
184 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.9415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1615  hypothetical protein  29.24 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000108302  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1208  hypothetical protein  24.84 
 
 
198 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1913  hypothetical protein  23.45 
 
 
224 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1441  hypothetical protein  31.58 
 
 
225 aa  51.2  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284407  hitchhiker  0.0013886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1923  hypothetical protein  27.49 
 
 
211 aa  50.8  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0740  hypothetical protein  22.98 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176113  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0320  hypothetical protein  32.26 
 
 
214 aa  47  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0722  hypothetical protein  24.85 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00610528  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1568  hypothetical protein  37.04 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238081  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1481  hypothetical protein  30.19 
 
 
205 aa  43.9  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2117  hypothetical protein  33.96 
 
 
232 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1634  hypothetical protein  34.92 
 
 
220 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1268  hypothetical protein  29.82 
 
 
223 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2176  hypothetical protein  35.71 
 
 
212 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>