21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1208 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1208  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1913  hypothetical protein  39.38 
 
 
224 aa  150  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2117  hypothetical protein  37.43 
 
 
232 aa  140  9e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0740  hypothetical protein  45.35 
 
 
182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176113  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1481  hypothetical protein  38.51 
 
 
205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0320  hypothetical protein  35.23 
 
 
214 aa  126  3e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1568  hypothetical protein  38.07 
 
 
193 aa  125  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238081  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1923  hypothetical protein  35.59 
 
 
211 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2176  hypothetical protein  37.36 
 
 
212 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1268  hypothetical protein  34.22 
 
 
223 aa  119  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1441  hypothetical protein  32.49 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284407  hitchhiker  0.0013886 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1634  hypothetical protein  28.73 
 
 
220 aa  68.2  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1103  hypothetical protein  25.77 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0541  hypothetical protein  28.46 
 
 
184 aa  61.2  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.9415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1526  hypothetical protein  24.67 
 
 
162 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.774017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1148  hypothetical protein  24.84 
 
 
169 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0221  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0758  hypothetical protein  24.38 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1691  hypothetical protein  26.97 
 
 
162 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0909  hypothetical protein  26.71 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.784757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1615  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000108302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>