21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1481 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1481  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  428  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2117  hypothetical protein  55.44 
 
 
232 aa  235  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2176  hypothetical protein  56.45 
 
 
212 aa  226  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1568  hypothetical protein  52.17 
 
 
193 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.238081  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1923  hypothetical protein  45.6 
 
 
211 aa  177  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0740  hypothetical protein  39.06 
 
 
182 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0176113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1208  hypothetical protein  38.51 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1913  hypothetical protein  35.48 
 
 
224 aa  117  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0906214 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1634  hypothetical protein  34.16 
 
 
220 aa  115  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1268  hypothetical protein  32.43 
 
 
223 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0320  hypothetical protein  29.9 
 
 
214 aa  97.8  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1441  hypothetical protein  30.65 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284407  hitchhiker  0.0013886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0541  hypothetical protein  39.29 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.9415  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1615  hypothetical protein  31.67 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000108302  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1103  hypothetical protein  37.74 
 
 
169 aa  52  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1691  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0909  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.784757  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0221  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  48.9  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1526  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.774017  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0758  hypothetical protein  32.08 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1148  hypothetical protein  30.19 
 
 
169 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>