51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1317 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
649 aa  1296    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  55.19 
 
 
540 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  52.76 
 
 
559 aa  178  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  50.96 
 
 
443 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  51.01 
 
 
197 aa  156  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  48.98 
 
 
293 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  50.7 
 
 
291 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  49.3 
 
 
268 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  49.66 
 
 
310 aa  147  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  46.21 
 
 
310 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  45.52 
 
 
310 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  45.52 
 
 
310 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  40.37 
 
 
270 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  48.57 
 
 
265 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  47.14 
 
 
288 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  48.92 
 
 
294 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  48.92 
 
 
294 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  48.25 
 
 
277 aa  134  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  43.42 
 
 
456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  41.89 
 
 
270 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  47.01 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  41.89 
 
 
268 aa  126  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  41.61 
 
 
269 aa  126  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  41.89 
 
 
270 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  48.2 
 
 
294 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  40.54 
 
 
269 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  44.83 
 
 
446 aa  120  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  34.27 
 
 
265 aa  84  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  26.78 
 
 
873 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  26.37 
 
 
6276 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
835 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  24.43 
 
 
1189 aa  45.8  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  36.62 
 
 
293 aa  45.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  41.43 
 
 
273 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  39.71 
 
 
277 aa  45.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.48 
 
 
792 aa  45.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  38.57 
 
 
272 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  40 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  40 
 
 
273 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  44.3  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  33.8 
 
 
283 aa  43.9  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  36.26 
 
 
266 aa  43.9  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  43.9  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>