28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0839 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  100 
 
 
270 aa  544  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  51.5 
 
 
265 aa  279  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  47.33 
 
 
268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  43.81 
 
 
291 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  47.69 
 
 
293 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  49.32 
 
 
540 aa  139  7e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  40.37 
 
 
649 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  47.83 
 
 
310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  47.95 
 
 
443 aa  135  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  45.65 
 
 
310 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  44.93 
 
 
310 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  44.93 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  43.45 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  43.26 
 
 
559 aa  130  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  48.55 
 
 
197 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  43.95 
 
 
294 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  43.95 
 
 
294 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  42.04 
 
 
456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  42.68 
 
 
277 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  49.57 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  41.61 
 
 
294 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  41.67 
 
 
446 aa  105  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  37.24 
 
 
270 aa  99.4  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  37.68 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  34.72 
 
 
269 aa  95.9  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  35.51 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  36.18 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  34.03 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>