23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8105 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8105    100 
 
 		 460 bp  912    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  85.89 
 
 		 798 bp  339  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3834  hypothetical protein  91.89 
 
 		 1329 bp  149  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5677    96.67 
 
 		 126 bp  103  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  89.87 
 
 		 870 bp  93.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6820  transposase IS3/IS911 family protein  93.22 
 
 		 240 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  88.61 
 
 		 870 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  88.61 
 
 		 870 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  88.61 
 
 		 870 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  88.61 
 
 		 870 bp  85.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0149    86.08 
 
 		 180 bp  69.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0847    84.31 
 
 		 107 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1578    92 
 
 		 195 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6190    91.49 
 
 		 144 bp  61.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4792    94.74 
 
 		 363 bp  60  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  94.74 
 
 		 618 bp  60  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4008    90.7 
 
 		 126 bp  54  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3515  hypothetical protein  90.7 
 
 		 216 bp  54  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3983    83.12 
 
 		 152 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  100 
 
 		 678 bp  50.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3676  integrase, catalytic region  96.43 
 
 		 117 bp  48.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2016  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 279 bp  46.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3583  transposase IS3/IS911 family protein  91.43 
 
 		 279 bp  46.1  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>