16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4792 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4792    100 
 
 		 363 bp  720    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0120  hypothetical protein  95.84 
 
 		 618 bp  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  84.66 
 
 		 870 bp  260  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  84.66 
 
 		 870 bp  260  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  84.37 
 
 		 870 bp  252  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  84.37 
 
 		 870 bp  252  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  84.37 
 
 		 870 bp  252  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  84.18 
 
 		 798 bp  115  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1009  transposase  79.15 
 
 		 678 bp  101  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5677    93.18 
 
 		 126 bp  63.9  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8105    94.74 
 
 		 460 bp  60  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0800  IstB ATP binding domain-containing protein  96.97 
 
 		 525 bp  58  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.844919 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  96.97 
 
 		 849 bp  58  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0185    87.72 
 
 		 144 bp  58  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3120    93.94 
 
 		 890 bp  50.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.269434  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3520  hypothetical protein  79.83 
 
 		 171 bp  46.1  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.707405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>