95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0853 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  66.24 
 
 
426 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  66.81 
 
 
426 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  66.52 
 
 
435 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  66.45 
 
 
193 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  39.56 
 
 
449 aa  158  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1518  hypothetical protein  35.94 
 
 
138 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0425914  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  28.57 
 
 
492 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  28.1 
 
 
483 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3691  transposase, unclassified family  29.07 
 
 
312 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.530416  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2280  transposase, unclassified family  29.07 
 
 
300 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  26.51 
 
 
506 aa  55.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  29.07 
 
 
503 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1519  hypothetical protein  52.27 
 
 
66 aa  52.8  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0852409  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  26.1 
 
 
506 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  27.06 
 
 
490 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  21.7 
 
 
472 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  20.76 
 
 
493 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  21.03 
 
 
389 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  21.21 
 
 
493 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0277  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1922  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2533  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1706  ISAfe4, transposase orf3  25.2 
 
 
545 aa  45.8  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.249951  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2057  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0517052  normal  0.35423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2522  transposase IS66  29.71 
 
 
546 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  24.71 
 
 
527 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  37.04 
 
 
382 aa  45.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  20.52 
 
 
389 aa  45.4  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  20.52 
 
 
389 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2470  ISAfe4, transposase orf3  24.8 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1756  transposase IS66  24.8 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2093  transposase IS66  24.8 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0266  transposase IS66  24.8 
 
 
545 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1326  transposase IS66  24.41 
 
 
545 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0424374 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  23.93 
 
 
448 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1021  transposase IS66  22.4 
 
 
509 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000296334  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  23.71 
 
 
424 aa  43.5  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0151  transposase IS66  22.4 
 
 
509 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736539  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  22.48 
 
 
514 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  21.57 
 
 
514 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>