More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1372 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  99.76 
 
 
424 aa  864    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  100 
 
 
329 aa  680    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  925    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  100 
 
 
167 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  35.28 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  35.06 
 
 
493 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  35.52 
 
 
492 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  38.65 
 
 
482 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  38.65 
 
 
482 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  38.65 
 
 
482 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  38.65 
 
 
482 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  38.65 
 
 
482 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  38.2 
 
 
482 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  38.2 
 
 
482 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  38.2 
 
 
482 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  38.2 
 
 
482 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  38.2 
 
 
478 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  33.93 
 
 
472 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  38.1 
 
 
382 aa  237  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  35.51 
 
 
483 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  36.82 
 
 
389 aa  196  9e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  37.65 
 
 
388 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  36.43 
 
 
389 aa  192  9e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  36.43 
 
 
389 aa  192  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  37.65 
 
 
407 aa  169  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  31.73 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  37.81 
 
 
311 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  28.7 
 
 
492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  40.62 
 
 
364 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  28 
 
 
492 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  28.76 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  40.71 
 
 
248 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  28.6 
 
 
426 aa  132  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  29.06 
 
 
490 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  27.83 
 
 
426 aa  123  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  26.59 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  26.06 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  26.06 
 
 
469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  27.89 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  26.37 
 
 
506 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  32.39 
 
 
227 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  26.37 
 
 
506 aa  97.8  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  25.38 
 
 
503 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  34.97 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00380  transposase and inactivated derivative  27.27 
 
 
254 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3724  hypothetical protein  25.91 
 
 
527 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6486  transposase IS66  23.78 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212807  normal  0.436333 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6513  transposase IS66  23.78 
 
 
521 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0611457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>