43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5532 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  88.82 
 
 
426 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  82.89 
 
 
426 aa  257  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  82.24 
 
 
435 aa  256  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  66.45 
 
 
243 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  41.1 
 
 
449 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1518  hypothetical protein  41.94 
 
 
138 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0425914  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  28.99 
 
 
492 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  28.26 
 
 
492 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  30.86 
 
 
490 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>