More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0557 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  83.1 
 
 
426 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  80.62 
 
 
435 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  100 
 
 
426 aa  861    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  66.24 
 
 
243 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  80.42 
 
 
192 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5532  hypothetical protein  82.89 
 
 
193 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  37.08 
 
 
449 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  74.64 
 
 
184 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  77.44 
 
 
144 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  29.89 
 
 
492 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  29.41 
 
 
492 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  70.19 
 
 
106 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  28.6 
 
 
448 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  29.51 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  26.68 
 
 
490 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  29 
 
 
482 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  29 
 
 
482 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  29.07 
 
 
482 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  29.07 
 
 
482 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  29.07 
 
 
482 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  29.07 
 
 
482 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  29.43 
 
 
478 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  28.93 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  28.95 
 
 
503 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  28.84 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  28.77 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  25.24 
 
 
472 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  31.53 
 
 
329 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  24.53 
 
 
493 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  24.3 
 
 
493 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  24.65 
 
 
492 aa  100  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  27.79 
 
 
483 aa  99  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  36.45 
 
 
248 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  25.96 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  32.41 
 
 
238 aa  97.8  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  25.96 
 
 
469 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  22 
 
 
506 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1518  hypothetical protein  39.37 
 
 
138 aa  90.5  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0425914  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  29.57 
 
 
311 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  21.96 
 
 
506 aa  86.3  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2795  transposase IS66  26.49 
 
 
532 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  25.2 
 
 
382 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1224  transposase IS66  26.08 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.321237  normal  0.0414458 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1376  transposase IS66  26.32 
 
 
502 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154743  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  27.42 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  31.77 
 
 
407 aa  76.6  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1864  transposase IS66  28.42 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  92.5 
 
 
74 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>