34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4333 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4333  transposase  100 
 
 
106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  72.12 
 
 
426 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  71.43 
 
 
192 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  69.52 
 
 
184 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  70.19 
 
 
426 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  71.43 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  71.15 
 
 
435 aa  135  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  87.5 
 
 
74 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  37.27 
 
 
424 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  37.27 
 
 
329 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  37.27 
 
 
448 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  37.27 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  40.7 
 
 
483 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  33.64 
 
 
482 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  33.64 
 
 
482 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  33.93 
 
 
482 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>