86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2589 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  100 
 
 
167 aa  345  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  100 
 
 
424 aa  325  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  100 
 
 
329 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  100 
 
 
448 aa  325  2.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  44.37 
 
 
482 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  44.37 
 
 
478 aa  115  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  43.75 
 
 
248 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  36.24 
 
 
492 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  36.24 
 
 
472 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  36.24 
 
 
493 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  36.71 
 
 
483 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  34.67 
 
 
492 aa  73.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  33.12 
 
 
492 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  39.1 
 
 
426 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  36.94 
 
 
426 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  37.11 
 
 
435 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  36.48 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0608  hypothetical protein  39.52 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  35.15 
 
 
490 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  30.86 
 
 
484 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0907  transposase, degenerate  35.34 
 
 
128 aa  53.9  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  34.62 
 
 
311 aa  53.9  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  31.33 
 
 
562 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  34.72 
 
 
144 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  32.68 
 
 
184 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  46.67 
 
 
364 aa  51.6  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  46.67 
 
 
407 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  33.71 
 
 
382 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  34.78 
 
 
388 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  34.78 
 
 
389 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  37.27 
 
 
106 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  34.78 
 
 
389 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  34.78 
 
 
389 aa  44.7  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>