104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1420 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1420  transposase  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  83.33 
 
 
407 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  82.95 
 
 
364 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  39.15 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  38.72 
 
 
493 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  38.3 
 
 
492 aa  168  6e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  38.3 
 
 
493 aa  168  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  40.27 
 
 
482 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  39.82 
 
 
478 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  40.71 
 
 
424 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  40.71 
 
 
329 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  40.71 
 
 
448 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0608  hypothetical protein  55.88 
 
 
152 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  33.47 
 
 
311 aa  122  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  36.28 
 
 
426 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  36.21 
 
 
449 aa  109  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  43.75 
 
 
167 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  36.49 
 
 
483 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  36.45 
 
 
426 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  36.25 
 
 
238 aa  102  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  38.43 
 
 
484 aa  101  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  34.96 
 
 
435 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  38.04 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  34.27 
 
 
562 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  30.32 
 
 
492 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  40.2 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  40.2 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  40.2 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  32.08 
 
 
492 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  39.22 
 
 
389 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  32.39 
 
 
382 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  34.1 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  34.1 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  29.02 
 
 
503 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00379  transposase  35.86 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  24.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  34.46 
 
 
144 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2283  transposase IS66  31.98 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3694  transposase IS66  31.98 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  37.5 
 
 
184 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>