180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2884 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  100 
 
 		 562 aa  1116    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  91.82 
 
 		 225 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2572  hypothetical protein  76.67 
 
 		 191 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  27.11 
 
 		 493 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  26.86 
 
 		 493 aa  147  5e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  26.92 
 
 		 472 aa  146  9e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  27.18 
 
 		 492 aa  143  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  28.81 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  30.79 
 
 		 484 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  29.5 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  26.25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  26.25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  30.56 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  26.25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  26.25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  26.25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  25.65 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  26.05 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  26.05 
 
 		 482 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  25.65 
 
 		 482 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  25.45 
 
 		 478 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  31.77 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  23.9 
 
 		 490 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  26.52 
 
 		 388 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  27.76 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  25.86 
 
 		 389 aa  90.9  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  33.85 
 
 		 248 aa  90.9  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  30.91 
 
 		 227 aa  89.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  26.7 
 
 		 382 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  25.52 
 
 		 389 aa  87.4  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  25.54 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  35.74 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  29.15 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  27.62 
 
 		 449 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  27.58 
 
 		 492 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  27.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  24.41 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  30.09 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  31.9 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  42.53 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  24.18 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  26.21 
 
 		 530 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  30.33 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  29.87 
 
 		 426 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3418  hypothetical protein  54.9 
 
 		 81 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  24.54 
 
 		 503 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  25.73 
 
 		 694 aa  52  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>