109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3164 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  58.15 
 
 		 364 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  83.33 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  34.3 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  33.91 
 
 		 493 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  33.62 
 
 		 493 aa  208  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  33.83 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  37.31 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  37.31 
 
 		 482 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  37.31 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  37.31 
 
 		 482 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  37.31 
 
 		 482 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  37.61 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  37.61 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  37.61 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  37.61 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  37.61 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  51.72 
 
 		 227 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  83.02 
 
 		 159 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  37.65 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  37.35 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  29.57 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  30.56 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  28.9 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  35.94 
 
 		 484 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  28.9 
 
 		 389 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  28.9 
 
 		 389 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  42.86 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  32.64 
 
 		 483 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  29.31 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1220  transposase IS66  36.9 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.035685 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  31.43 
 
 		 562 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  36.91 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  26.28 
 
 		 492 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  26.2 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  33.47 
 
 		 289 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  27.86 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  26.97 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  36.44 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  25.98 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  29.65 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  29.65 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  23.9 
 
 		 506 aa  69.7  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  23.9 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  20 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  46.67 
 
 		 167 aa  50.8  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2793  transposase IS66  23.38 
 
 		 523 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0349663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  42.86 
 
 		 192 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  25.45 
 
 		 544 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  23.51 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  24.6 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3331  transposase IS66  25.63 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3926  transposase IS66  25.63 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3964  transposase IS66  25.63 
 
 		 514 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  23.68 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  23.68 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>