67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1938 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  56.4 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  36.5 
 
 		 227 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  32.02 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  32.02 
 
 		 389 aa  109  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  32.02 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  32.41 
 
 		 493 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  32.02 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  31.62 
 
 		 389 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  31.62 
 
 		 492 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  36.55 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  31.71 
 
 		 472 aa  103  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  32.16 
 
 		 484 aa  99.4  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  31.71 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  42.86 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  28.57 
 
 		 478 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  28.14 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  28.14 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  28.14 
 
 		 482 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  28.57 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  30.31 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  30.14 
 
 		 562 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  29.17 
 
 		 448 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  24.47 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2572  hypothetical protein  28.65 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  30.46 
 
 		 225 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  28.64 
 
 		 424 aa  52.8  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  47.17 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  47.17 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  39.13 
 
 		 432 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  47.17 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  47.17 
 
 		 462 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  45.83 
 
 		 445 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  26.04 
 
 		 449 aa  49.7  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  33 
 
 		 364 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  53.33 
 
 		 394 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  53.33 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  40.85 
 
 		 390 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  43.75 
 
 		 389 aa  45.8  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3015  transposase  44 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  40.3 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  40.3 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  40.82 
 
 		 427 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0265932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>