80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0609 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0609  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3164  hypothetical protein  51.72 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.932938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  32.9 
 
 		 493 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  32.47 
 
 		 493 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0479  hypothetical protein  32.47 
 
 		 389 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  32.47 
 
 		 389 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  32.03 
 
 		 389 aa  132  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  32.9 
 
 		 388 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  32.47 
 
 		 492 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  31.25 
 
 		 472 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1938  hypothetical protein  36.5 
 
 		 314 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162876  normal  0.0969358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4024  hypothetical protein  39.32 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4145  transposase IS66  37.07 
 
 		 484 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  32.27 
 
 		 478 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7112  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.378871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  31.82 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  31.82 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  31.82 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  31.82 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  32.27 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  31.82 
 
 		 482 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  32.27 
 
 		 482 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  32.27 
 
 		 482 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  32.27 
 
 		 482 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  33.68 
 
 		 382 aa  106  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3072  hypothetical protein  53.61 
 
 		 364 aa  101  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  32.39 
 
 		 448 aa  98.2  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  33.5 
 
 		 424 aa  92  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2884  transposase IS66  30.91 
 
 		 562 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000946302  normal  0.757994 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2572  hypothetical protein  34.86 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.73941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  28.76 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  32.16 
 
 		 492 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2439  hypothetical protein  28.77 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.265104  normal  0.897623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  26.01 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  26.01 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  47.46 
 
 		 329 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4903  transposase IS66  26.39 
 
 		 529 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3678  transposase IS66  26 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  22.07 
 
 		 490 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1021  transposase IS66  22.51 
 
 		 509 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000296334  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0151  transposase IS66  22.51 
 
 		 509 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000736539  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  26.77 
 
 		 530 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>