107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00379 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00379  transposase  100 
 
 
205 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613605  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  100 
 
 
469 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  100 
 
 
469 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  36.42 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  33.14 
 
 
503 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  29.53 
 
 
483 aa  74.7  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2283  transposase IS66  32.69 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3694  transposase IS66  32.48 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  33.33 
 
 
482 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  32.62 
 
 
478 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  32.09 
 
 
492 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  32.09 
 
 
472 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  32.09 
 
 
493 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  25.57 
 
 
424 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  26.04 
 
 
448 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  32.62 
 
 
482 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  26.04 
 
 
329 aa  60.1  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  29.88 
 
 
426 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  28.66 
 
 
435 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  30.35 
 
 
449 aa  57.8  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  28.64 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  27.62 
 
 
492 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  25.56 
 
 
492 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  28.57 
 
 
426 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  27.08 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  26.92 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0124  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0251  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0300  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0187  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.460976  hitchhiker  0.00443516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1381  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590129  normal  0.0305803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2098  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000076493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2977  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743776  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4126  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00441007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4566  transposase IS66  25.13 
 
 
490 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0907  transposase, degenerate  36.96 
 
 
128 aa  52  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.407207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2819  transposase IS66  27.14 
 
 
506 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0063  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.394688  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0005  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0047  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.637398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1757  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3368  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4879  IS66 family transposase  27.59 
 
 
523 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3126  IS66 family transposase orfB  27.2 
 
 
524 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0078  transposase family  27.13 
 
 
533 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  7.38697e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1519  transposase IS66  27.14 
 
 
506 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292067  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0036  transposase family  27.35 
 
 
410 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  27.27 
 
 
144 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>