82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5010 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5010  transposase  100 
 
 
144 aa  285  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  87.22 
 
 
435 aa  226  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  82.71 
 
 
426 aa  219  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  81.34 
 
 
192 aa  207  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  77.44 
 
 
426 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  71.54 
 
 
184 aa  180  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  71.43 
 
 
106 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  90 
 
 
74 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  34.46 
 
 
248 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  34.96 
 
 
482 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  34.45 
 
 
478 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  33.87 
 
 
482 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  34.15 
 
 
482 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  34.15 
 
 
482 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  35.17 
 
 
329 aa  52  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  34.72 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  35.17 
 
 
424 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  35.17 
 
 
448 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  30.61 
 
 
492 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  30.61 
 
 
493 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  30.61 
 
 
472 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  29.93 
 
 
492 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  29.03 
 
 
492 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  39.53 
 
 
483 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  30.22 
 
 
238 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3694  transposase IS66  31.21 
 
 
239 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03600  transposase and inactivated derivative  25.66 
 
 
469 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01287  hypothetical transposase  25.66 
 
 
469 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2283  transposase IS66  31.21 
 
 
212 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  31.21 
 
 
503 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0608  hypothetical protein  34.57 
 
 
152 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  30.71 
 
 
449 aa  40.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>