82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3166 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3166  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  74.64 
 
 
426 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  72.46 
 
 
435 aa  197  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5531  transposase  71.74 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  71.01 
 
 
426 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5010  transposase  71.54 
 
 
144 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4333  transposase  69.52 
 
 
106 aa  140  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570656  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3451  hypothetical protein  85 
 
 
74 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0193  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0220  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1457  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2952  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3186  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3447  transposase IS66  38.66 
 
 
482 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1806  transposase IS66  37.5 
 
 
482 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1295  transposase IS66  37.82 
 
 
482 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.364836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1432  transposase IS66  37.82 
 
 
482 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1420  transposase  37.5 
 
 
248 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2589  transposase  32.68 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0616446  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1572  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0259389  hitchhiker  0.00000634626 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4580  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.88009  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1285  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3784  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0913581  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0147  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.934623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4602  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123962  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0463  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112449  normal  0.163248 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5321  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.549813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0876  transposase IS66  37.82 
 
 
478 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1019  transposase IS66  35.21 
 
 
503 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403229  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2283  transposase IS66  35.21 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3694  transposase IS66  36.57 
 
 
239 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1517  transposase of ISBst12-like element  37.23 
 
 
238 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0223897  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0266  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2379  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.651042  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2586  transposase IS66  32.68 
 
 
424 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.82349  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2596  transposase IS66  35.56 
 
 
329 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2819  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1372  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.568807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1414  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.764457  normal  0.239155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1877  transposase IS66  35.07 
 
 
448 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  35 
 
 
483 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  34.18 
 
 
449 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  32 
 
 
492 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0315  transposase  30.37 
 
 
492 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2297  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2104  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1167  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1117  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0915  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0866  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.244852  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0744  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.865371  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0648  transposase  30.37 
 
 
493 aa  44.7  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.109485  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2252  transposase  30.37 
 
 
472 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0608  hypothetical protein  35.53 
 
 
152 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0539  transposase  33.7 
 
 
389 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0401  transposase  33.7 
 
 
389 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.82077  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0162  transposase  33.7 
 
 
388 aa  42  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>