35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1519 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1519  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0852409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2278  transposase IS66  98.48 
 
 
449 aa  135  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.887455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6835  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6406  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6173  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2244  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0633  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8731  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8271  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8229  hypothetical protein  53.85 
 
 
426 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0557  transposase IS66  53.85 
 
 
426 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8257  hypothetical protein  52.94 
 
 
435 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043578  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0853  hypothetical protein  52.27 
 
 
243 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.609493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2973  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393284  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0309  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0216925  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1997  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2013  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2058  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2391  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.839269  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0184  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.273708 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0132  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0106  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0097  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0047  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4987  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.212286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4585  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4544  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17163  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4350  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3682  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3455  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000270677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3106  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0557582  normal  0.415415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2688  transposase IS66  44.07 
 
 
492 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0954608  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0353  hypothetical protein  39.66 
 
 
483 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5405  transposase IS66  40.68 
 
 
492 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0174137  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0682  transposase  41.07 
 
 
382 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000313916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>