18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0171 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  100 
 
 		 99 aa  193  7e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  92.93 
 
 		 98 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  91.92 
 
 		 98 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  76.77 
 
 		 99 aa  150  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  50 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  44.79 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  43.62 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  39.36 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  38.83 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  36.26 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  34.78 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  38.04 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  39.56 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  35.79 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  34.29 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  36.84 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  32.29 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  46.15 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>