18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1266 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  100 
 
 
98 aa  192  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  93.88 
 
 
98 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  92.93 
 
 
99 aa  175  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  78.79 
 
 
99 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  48.48 
 
 
96 aa  97.4  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  44.09 
 
 
90 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  43.75 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  36.89 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  39.78 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  36.67 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  36.26 
 
 
88 aa  62.8  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  33.01 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  35.11 
 
 
93 aa  54.7  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  37.36 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  31.91 
 
 
91 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  35.11 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  35.16 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  41.67 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>