17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2226 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 154 aa  309  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  75.32 
 
 		 134 aa  216  7.999999999999999e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  45 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  38.96 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  37.01 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  38.67 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  37.36 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  38.1 
 
 		 110 aa  51.2  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  38.1 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  39.39 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  43.06 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  46.15 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  40 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  41.67 
 
 		 98 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  37.14 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  36.36 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  38.18 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>