21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1836 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 101 aa  201  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  57.69 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  40.3 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  38.96 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  37.78 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  34.65 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  33.98 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  40.91 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  37.11 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  36.17 
 
 		 94 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  31.11 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  39.77 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  39.56 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  36.67 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  47.54 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  31.82 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  27.27 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  35.16 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  34.94 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  35.16 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00189  ribonuclease P complex subunit Pop4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11150)  30.56 
 
 		 268 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal  0.254222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>