20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0102 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  100 
 
 		 110 aa  216  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  55.34 
 
 		 101 aa  111  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  40.38 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  43.62 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  36.89 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  38.83 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  36.89 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  38.83 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  34.38 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  38.71 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  33.98 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  42.05 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  35.79 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  31.2 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  37.23 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  31.96 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  32.65 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  38.1 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  30.85 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  32.98 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>