19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0486 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 94 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  46.07 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  44.94 
 
 		 91 aa  72.4  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  39.56 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  42.7 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  41.94 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  39.36 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  39.78 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  42.53 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  46.67 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  36.17 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  33.33 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  36.17 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  38.78 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  31.96 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  34.12 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  37.21 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  41.18 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  38.18 
 
 		 154 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>