20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0450 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 91 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  55.56 
 
 		 90 aa  99.8  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  52.75 
 
 		 91 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  50.59 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  48.89 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  44.94 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  46.74 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  46.77 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  36.47 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  37.23 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  37.65 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  32.63 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  31.91 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  31.91 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  36.67 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  35.87 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  32.29 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  39.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  37.14 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  34.74 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>