21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0572 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0572  ribonuclease P, Rpp29  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270481  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0540  ribonuclease P, Rpp29  60 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.116302  normal  0.780083 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0450  Ribonuclease P, Rpp29  55.56 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0208067  normal  0.676898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2245  ribonuclease P subunit  52.22 
 
 		 91 aa  94.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000149463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1720  ribonuclease P, Rpp29  52.22 
 
 		 96 aa  89  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000678926  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0486  ribonuclease P, Rpp29  46.07 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1392  ribonuclease P protein component 1  41.3 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0102  ribonuclease P protein component 1  43.62 
 
 		 110 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.276716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1266  ribonuclease P protein component 1  44.09 
 
 		 98 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000002979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0718  ribonuclease P protein component 1  42.55 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00304723  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0171  ribonuclease P protein component 1  43.62 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.0000504687  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0652  ribonuclease P protein component 1  43.01 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000000274368  decreased coverage  0.0000593448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0009  ribonuclease P protein component 1  42.05 
 
 		 101 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000469869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2441  ribonuclease P protein component 1  42.5 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.616696 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0802  ribonuclease P  38.37 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.462898 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1836  Ribonuclease P, Rpp29  40.91 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.670408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1513  Ribonuclease P, Rpp29  37.65 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.42497e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2300  ribonuclease P protein component 1  37.89 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0218  Ribonuclease P, Rpp29  43.48 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2226  Ribonuclease P, Rpp29  40 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00189  ribonuclease P complex subunit Pop4, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11150)  45.28 
 
 		 268 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.481163  normal  0.254222 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>