24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0579 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0579  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  709    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339762  hitchhiker  0.0000347272 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0686  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000157748  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3261  hypothetical protein  25.45 
 
 
251 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014751  hitchhiker  0.0000121737 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0752  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00298481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0700  hypothetical protein  25 
 
 
251 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000147849  hitchhiker  0.000148247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3285  hypothetical protein  24.42 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0505048  hitchhiker  0.000246536 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0710  hypothetical protein  24.09 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.410698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0731  protein of unknown function DUF481  23.64 
 
 
247 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000132441  hitchhiker  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0740  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000500329  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3644  hypothetical protein  23.64 
 
 
247 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000124667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3587  hypothetical protein  24.3 
 
 
247 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.204251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0756  hypothetical protein  25.57 
 
 
249 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216313  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1733  hypothetical protein  25.35 
 
 
317 aa  56.6  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0231419  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4213  hypothetical protein  23.29 
 
 
249 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195016  hitchhiker  0.000349999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3931  hypothetical protein  25.11 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3011  hypothetical protein  28.77 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3065  putative salt-induced outer membrane protein  26.17 
 
 
248 aa  50.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124339  normal  0.234711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2791  hypothetical protein  24.07 
 
 
245 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00000611146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0652  hypothetical protein  25.11 
 
 
246 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000354938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0514  hypothetical protein  21.36 
 
 
251 aa  47  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0608195  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0381  hypothetical protein  24.12 
 
 
333 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.542158  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3352  hypothetical protein  20.64 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000185649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0876  hypothetical protein  24.35 
 
 
245 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2309  protein of unknown function DUF481  23.26 
 
 
244 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.070466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>