36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0970 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0970  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
209 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5274  ABC transporter, permease protein  74.88 
 
 
212 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5363  ABC transporter, permease protein  74.88 
 
 
212 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5653  ABC transporter, permease protein  74.88 
 
 
212 aa  240  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3866  ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 
210 aa  161  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0412  integral membrane family protein  44.55 
 
 
202 aa  145  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.988927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3651  ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
207 aa  144  9e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4237  ABC transporter, permease protein  47.57 
 
 
201 aa  141  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.961517  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3821  hypothetical protein  46.7 
 
 
196 aa  137  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3442  hypothetical protein  47.57 
 
 
198 aa  128  7.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.310689  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0823  hypothetical protein  43.94 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1979  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0587  ABC transporter, permease protein  43.88 
 
 
200 aa  121  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0251  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  48.37 
 
 
205 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0460  hypothetical protein  35.96 
 
 
264 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11760  predicted membrane protein  37.97 
 
 
193 aa  108  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0944  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  37.04 
 
 
189 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2046  membrane protein-like protein  43.85 
 
 
195 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1491  ABC-type cobalt transport system, permease component  32.79 
 
 
192 aa  96.3  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1411  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  35.03 
 
 
196 aa  92.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0769  hypothetical protein  32.43 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.11044  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0607  hypothetical protein  32.77 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0161306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1159  hypothetical protein  31.28 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1137  hypothetical protein  31.28 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.626624  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07500  predicted membrane protein  25.41 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.666219 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0068  ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0662  hypothetical protein  30.05 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.588476  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1661  membrane protein-like protein  40.2 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1545  ABC-type cobalt transport system, membrane component  34.17 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0191855  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0073  ABC-type cobalt transport system, permease component  32.64 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0174  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.7  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23330  predicted membrane protein  35.97 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0175  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  62.4  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0836  hypothetical protein  39.73 
 
 
184 aa  59.3  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0089  hypothetical protein  29.29 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08010  predicted membrane protein  33.09 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.146812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>