36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0460 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0460  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1979  hypothetical protein  50.78 
 
 		 213 aa  192  7e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0412  integral membrane family protein  38.5 
 
 		 202 aa  136  4e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.988927 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0823  hypothetical protein  35.75 
 
 		 199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11760  predicted membrane protein  38.62 
 
 		 193 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0970  ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4237  ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.961517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3651  ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 207 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3821  hypothetical protein  34.72 
 
 		 196 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3442  hypothetical protein  35.71 
 
 		 198 aa  95.5  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.310689  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3866  ABC transporter, permease protein  33.16 
 
 		 210 aa  92  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5274  ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5363  ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5653  ABC transporter, permease protein  33.01 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0944  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  32.07 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0587  ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07500  predicted membrane protein  29.02 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.666219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1411  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  31.05 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23330  predicted membrane protein  33.57 
 
 		 212 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1491  ABC-type cobalt transport system, permease component  27.03 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0089  hypothetical protein  32.8 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0769  hypothetical protein  24.46 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.11044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0836  hypothetical protein  30.53 
 
 		 184 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2046  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0251  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  26.6 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0174  hypothetical protein  26.95 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0175  hypothetical protein  26.34 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0662  hypothetical protein  29.08 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.588476  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1159  hypothetical protein  26.9 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1137  hypothetical protein  26.9 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.626624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0607  hypothetical protein  25.99 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0161306  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08010  predicted membrane protein  30.63 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.146812 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1661  membrane protein-like protein  30.26 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1545  ABC-type cobalt transport system, membrane component  28.03 
 
 		 196 aa  52.4  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0191855  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0073  ABC-type cobalt transport system, permease component  29.13 
 
 		 194 aa  43.5  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0068  ABC transporter, permease protein  25.44 
 
 		 200 aa  42.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>