32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08010  predicted membrane protein  100 
 
 		 222 aa  424  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.146812 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0089  hypothetical protein  61.62 
 
 		 204 aa  229  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0235527  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23330  predicted membrane protein  63.59 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1491  ABC-type cobalt transport system, permease component  34.38 
 
 		 192 aa  91.3  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0944  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  35.94 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0769  hypothetical protein  32.42 
 
 		 193 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.11044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0836  hypothetical protein  35.68 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.461944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0412  integral membrane family protein  31.84 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.988927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4237  ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.961517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1545  ABC-type cobalt transport system, membrane component  29.19 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0191855  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0073  ABC-type cobalt transport system, permease component  24.74 
 
 		 194 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3821  hypothetical protein  36.63 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24358  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3442  hypothetical protein  37.93 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.310689  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0174  hypothetical protein  31.62 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07500  predicted membrane protein  30.21 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.666219 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0460  hypothetical protein  26.22 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11760  predicted membrane protein  31.02 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3651  ABC transporter, permease protein  28.43 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1661  membrane protein-like protein  29.86 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0823  hypothetical protein  34.23 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0607  hypothetical protein  29.94 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0161306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3866  ABC transporter, permease protein  26.57 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0068  ABC transporter, permease protein  29 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1159  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1137  hypothetical protein  31.18 
 
 		 191 aa  62  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.626624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1979  hypothetical protein  26.09 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1411  ABC-type thiamin-related transport system, permease component 1, predicted  28.65 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0662  hypothetical protein  29.29 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.588476  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0175  hypothetical protein  25.51 
 
 		 202 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0587  ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2046  membrane protein-like protein  31.72 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0970  ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>