18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0542 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  474  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  31.37 
 
 		 222 aa  128  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  28.19 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  27.15 
 
 		 212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  27.53 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  26.15 
 
 		 214 aa  85.1  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  23.58 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  27.47 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  24.66 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  21.2 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  24.27 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  23.36 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  27.1 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  19.91 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  23.21 
 
 		 252 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  25.94 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  22.39 
 
 		 267 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0851  hypothetical protein  22.9 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>