18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0238 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  513  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  51.97 
 
 
252 aa  252  3e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  56.02 
 
 
252 aa  248  5e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  51.54 
 
 
267 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  48.24 
 
 
269 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  45.97 
 
 
256 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  48.78 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  47.56 
 
 
259 aa  203  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  34.6 
 
 
241 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  28.39 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  27.71 
 
 
257 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  26.43 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  23.98 
 
 
214 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  21.49 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  24.15 
 
 
272 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  25.94 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  21.88 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  26.13 
 
 
209 aa  42  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>