18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1395 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  490  1e-137  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  62.7 
 
 
252 aa  315  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  55.47 
 
 
267 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  54.72 
 
 
254 aa  250  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  51.57 
 
 
269 aa  238  9e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  51 
 
 
256 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  52.57 
 
 
259 aa  221  8e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  49.59 
 
 
252 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  30 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  24.68 
 
 
250 aa  113  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  29.11 
 
 
257 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  27.16 
 
 
253 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  27.66 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  23.85 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2178  hypothetical protein  19.67 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  20.96 
 
 
212 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  17.7 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  20.52 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>