17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0784 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  494  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  53.53 
 
 
256 aa  246  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  50 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  50.21 
 
 
252 aa  219  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  219  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  48.78 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  46.43 
 
 
259 aa  202  4e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  44.05 
 
 
269 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  28.99 
 
 
241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  29.08 
 
 
257 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  25.22 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  26.51 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2178  hypothetical protein  21.71 
 
 
274 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  25.2 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  19.76 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  23.21 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  24.12 
 
 
222 aa  45.8  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>