18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5224 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  28.64 
 
 		 222 aa  92  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  26.15 
 
 		 235 aa  85.1  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  28.31 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  24.78 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  25.2 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  68.2  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  23.77 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  23.98 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  23.93 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  23.66 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  22.31 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  22.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  21.71 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  22.47 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  26.28 
 
 		 253 aa  48.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  24.55 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  25.41 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>