17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1147 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  36.14 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  27.15 
 
 
235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  27.85 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  25.26 
 
 
209 aa  83.6  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  28.31 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  25.68 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  28.21 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  28.38 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  20.51 
 
 
208 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  21.49 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  22.47 
 
 
252 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1520  hypothetical protein  22.92 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000378207  hitchhiker  0.00000806607 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  20.96 
 
 
252 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  27.19 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  18.72 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  20.82 
 
 
267 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>