15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0153 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  23.58 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  30.14 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  23.14 
 
 
209 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  28.38 
 
 
212 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  25.31 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  19.76 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  18.99 
 
 
267 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  26.07 
 
 
241 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  20.88 
 
 
252 aa  49.3  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  29.75 
 
 
250 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  21.88 
 
 
254 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  25.41 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  19.42 
 
 
252 aa  42  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  20.52 
 
 
208 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>