16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4206 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  528  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  60.08 
 
 
269 aa  285  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  54.75 
 
 
252 aa  267  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  55.56 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  51.54 
 
 
254 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  46.95 
 
 
256 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  51.53 
 
 
259 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  31.71 
 
 
241 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  26.4 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  27.17 
 
 
257 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  23.77 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  18.99 
 
 
231 aa  52.4  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  21.71 
 
 
214 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  22.39 
 
 
235 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  24.17 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>