20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0520 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  46.9 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  28.99 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  30.9 
 
 		 256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  34.6 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  31.97 
 
 		 257 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  31.71 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  30.36 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  29.91 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2178  hypothetical protein  28.21 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  28.51 
 
 		 259 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  27.53 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  25.31 
 
 		 269 aa  99.4  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  25.34 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  24.78 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  25.81 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  25.68 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  26.07 
 
 		 231 aa  52  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  23.5 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  22.55 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>