19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1110 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  32.42 
 
 
235 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1147  hypothetical protein  36.24 
 
 
212 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0228533 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  30.09 
 
 
209 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  29.22 
 
 
214 aa  99.4  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2251  hypothetical protein  27.85 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  31.6 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2489  hypothetical protein  27.6 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.021093  normal  0.0429102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1520  hypothetical protein  27.93 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000378207  hitchhiker  0.00000806607 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  26.18 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  25.42 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  24.48 
 
 
252 aa  53.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  23.01 
 
 
256 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  25 
 
 
267 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  24.45 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  21.46 
 
 
252 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  23.81 
 
 
254 aa  45.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  22.86 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  21.48 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>