21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1943 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1943  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000154853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0617  preprotein translocase subunit SecE  59.42 
 
 
71 aa  89.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0632  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  60.78 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0369278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0900  preprotein translocase subunit SecE  54.72 
 
 
58 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.417951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0160  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  45.16 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.608101 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2937  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  50.94 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.171007  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0143  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.572762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2264  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  52.08 
 
 
68 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000131465  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1238  preprotein translocase subunit SecE  45.9 
 
 
79 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0680  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.725215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0410  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  48.39 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0469451  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0894  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
57 aa  57  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00661299  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2642  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  60 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1584  hypothetical protein  48.98 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000407146  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0746  preprotein translocase subunit SecE  44.83 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.126854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0659  protein translocase SEC61 complex gamma subunit  42.11 
 
 
63 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000841383  normal  0.782889 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1011  preprotein translocase subunit SecE  51.35 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1140  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  57.58 
 
 
59 aa  47  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0598453  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0865  protein translocase SEC61 complex, gamma subunit  46.34 
 
 
73 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17885  predicted protein  38 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04589  protein translocation complex subunit Sss1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06901)  33.33 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>